在应用程序中，持久层、业务层和控制层各自扮演着重要的角色，共同实现了应用程序的主要功能。

持久层是应用程序和数据库之间的桥梁，主要负责数据的存储和访问。具体来说，该层采用DAO模式，通过建立实体类和数据库表映射关系，负责完成对象数据和关系数据的转换，将应用程序中的数据持久化到数据库中，以供应用程序和数据库之间的数据交互使用。

业务层在持久层和控制层之间，负责处理数据的一层。该层的主要任务是对数据库中的数据进行加工和处理，使其更加符合业务需求。具体来说，业务层采用事务脚本模式，将一个业务中所有的操作封装成一个方法，并保证方法中所有的数据库更新操作都能同时成功或同时失败，避免了部分成功部分失败引起的数据混乱操作。

控制层是应用程序中最上层的一层，位于持久层和业务层之上。其主要任务是接收用户请求，处理用户提交的信息，并返回响应结果。具体来说，控制层可以采用MVC（Model-View-Controler）模式，通过Spring、Struts、Hibernate等框架进行实现。

持久层、业务层和控制层在应用程序中扮演着不同的角色，分别负责数据的存储和访问、数据处理和交互以及用户请求的处理和响应。它们相互协作，共同实现了应用程序的主要功能。